بیشتر مواد رنگی به کار رفته در خالکوبی یا در اصطلاح تاتو سمی و سرطان زا هستند و پاک کردن آنها نیز خطراتی در پی دارد.
۳۰۰ ترکیب رنگی مختلف که برای خالکوبی های رنگی استفاده می‌شوند از مواد شیمیایی سمی تشکیل شده اند و ممکن است عوارضی مانند التهاب، تحریک پوستی و حتی سرطان ایجاد کنند. هنگام خالکوبی در هر ثانیه ۲۰ نیش سوزن وارد پوست می‌شود و بخشی از ذرات رنگ وارد جریان خون و لنف می شود و غده‌های لنفاوری منطقه خالکوبی شده را سیاه می کند.

از سوی دیگر پاک کردن خالکوبی ها نیز که با استفاده از لیزر انجام می شود، مشکلاتی در پی دارد.
در این روش بلورهای رنگی خالکوبی، خرد و وارد دستگاه گردش خون و ایمنی بدن می شوند که ممکن است عوارض فراوانی از جمله سرطان ایجاد کنند.
خالکوبی افزون بر این عوارض خطر انتقال بیماری های عفونی خطرناک مانند هپاتیت و ایدز را نیز افزایش می دهد.